Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col4a5Q63ZW6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a5Q63ZW6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms