Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa13Q62424 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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