Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Supt6hQ62383 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Supt6hQ62383 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms