Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ss18Q62280 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ss18Q62280 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ss18Q62280 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ss18Q62280 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ss18Q62280 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ss18Q62280 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ss18Q62280 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Ss18Q62280 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ss18Q62280 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ss18Q62280 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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