Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SypQ62277 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SypQ62277 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SypQ62277 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SypQ62277 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SypQ62277 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SypQ62277 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms