Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sycp1Q62209 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sycp1Q62209 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms