Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbm38Q62176 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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