Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sin3bQ62141 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sin3bQ62141 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms