Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Prkd1Q62101 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prkd1Q62101 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prkd1Q62101 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms