Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phox2aQ62066 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phox2aQ62066 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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