Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VcanQ62059 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VcanQ62059 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VcanQ62059 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VcanQ62059 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms