Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prg2Q61878 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prg2Q61878 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Prg2Q61878 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prg2Q61878 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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