Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msi1Q61474 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms