Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcd1Q61466 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms