Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnna2Q61301 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms