Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1eQ61290 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1eQ61290 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms