Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbbp4Q60972 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbbp4Q60972 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rbbp4Q60972 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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