Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cep250Q60952 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cep250Q60952 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cep250Q60952 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep250Q60952 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep250Q60952 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep250Q60952 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep250Q60952 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep250Q60952 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cep250Q60952 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms