Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Caprin1Q60865 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms