Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ripk1Q60855 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ripk1Q60855 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ripk1Q60855 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ripk1Q60855 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ripk1Q60855 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ripk1Q60855 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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