Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tnfrsf8Q60846 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms