Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atf3Q60765 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atf3Q60765 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms