Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc27a1Q60714 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms