Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxd4Q60688 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms