Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Akap4Q60662 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Akap4Q60662 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms