Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClpbQ60649 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms