Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sin3aQ60520 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sin3aQ60520 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms