Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clec4a4Q5YIR8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms