Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trim38Q5SZ99 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim38Q5SZ99 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim38Q5SZ99 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim38Q5SZ99 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim38Q5SZ99 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim38Q5SZ99 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim38Q5SZ99 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim38Q5SZ99 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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