Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SynrgQ5SV85 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.1 ms