Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Phf12Q5SPL2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf12Q5SPL2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms