Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trdv2-2Q5R1A4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms