Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trdv4Q5R1A3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trdv4Q5R1A3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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