Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rtp3Q5QGU6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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