Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttf2Q5NC05 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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