Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps41Q5KU39 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms