Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf3Q5HZG4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms