Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SynaQ5G5D5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms