Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3558Q5FWC9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3558Q5FWC9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3558Q5FWC9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3558Q5FWC9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm3558Q5FWC9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3558Q5FWC9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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