Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ecm2Q5FW85 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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