Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prkaa1Q5EG47 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms