Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf5Q5EBH1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf5Q5EBH1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rassf5Q5EBH1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rassf5Q5EBH1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms