Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfmbt2Q5DTW2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt2Q5DTW2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms