Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnma5Q5DTT8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnma5Q5DTT8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms