Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Rtl5Q5DTT4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtl5Q5DTT4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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