Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam208bQ5DTT3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fam208bQ5DTT3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms