Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eri2Q5BKS4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms