Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
E2f8Q58FA4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
E2f8Q58FA4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms