Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Urb1Q571H0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Urb1Q571H0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Urb1Q571H0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Urb1Q571H0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Urb1Q571H0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Urb1Q571H0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Urb1Q571H0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Urb1Q571H0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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