Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bdp1Q571C7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms